Ο Αργεντινός επιθετικός δεν κατάφερε να αποδείξει την αξία του στην ομάδα της Ηπείρου, ενώ και οι τραυματισμοί που είχε δεν τον άφησαν να διεκδικήσει τη θέση του στα πλάνα του Γιάννη Πετράκη.
Ο Ροντρίγκες συμφώνησε με τον ΠΑΣ Γιάννινα για τη λύση του συμβολαίου του, η οποία ανακοινώθηκε από τον σύλλογο της Ηπείρου:
«Η ΠΑΕ ΠΑΣ ΓΙΑΝΝΙΝΑ 1966 ανακοινώνει τη λήξη συνεργασίας και τη διακοπή του συμβολαίου με τον ποδοσφαιριστή Jonathan Rodriguez. H ομάδα μας του εύχεται καλή επιτυχία και σταδιοδρομία στην ποδοσφαιρική του καριέρα».
